寻秦记星云的结局如何？
倪星云最后和赵雅琴在一起了。在穿越的这段漫长的日子里，星云也慢慢地在改变，他不再像从前那样玩世不恭，开始真正地去珍惜身边在乎的人。他不再像从前那样一味地执着于寻找时间裂缝，而是更加专注于现实。他开始接受这个事实：他注定回不去21世纪，他必须在战国这个时空里过完自己的一生。而当星云不再逃避现实，他才慢慢体会到了什么是真正的爱情，什么是真正的人生。
星云与琴师的故事是平淡又有些悲哀的，星云在一开始遇到琴师的时候，对她并没有什么感情，只是出于一个医生的本能去照顾她。而在赵雅琴帮助他解决了秦国医官的阻挠之后，星云才对琴师渐渐有了一丝好感。
琴师的身世之谜，让她对星云越来越依恋，星云在经历种种生死危机之后，也渐渐对琴师产生了感情。他们之间的爱情，与星云和紫晶、婠婠不同，星云与紫晶、婠婠的爱情是惊心动魄的，而星云与雅琴的爱情则是平淡温馨的。
琴师爱他，用了一生的时间去爱他，哪怕知道自己的死期将至，也无怨无悔。她把最后的希望放在星云身上，希望他离开那个可怕的女人，去寻找属于自己的爱情。她知道星云还在犹豫，便主动去成全他与婠婠的爱情。
琴师在临终前告诉星云，如果他可以找到时间裂缝，就不要忘了去找她。她说：“我答应你，我会在那里等你，永远地等你。我不怕痛苦，不怕寂寞，不怕人世间的任何折磨，只要知道你还在想着我，只要知道你还在为我而奋斗，只要知道你还在为我而活着，我就满足了。”她的话让星云感到了从未有过的温暖，他泪流满面地点头应允。
琴师安详地闭上了眼睛，嘴角带着一丝微笑，仿佛已经看到了星云回到现代找她一般。琴师的死让星云伤痛欲绝，他在琴师的坟前坐了3天3夜，不吃不喝，也不说话，整个人就像一具行尸走肉。
星云在琴师的坟前反省了自己的过失，他觉得琴师的死与自己有很大关系。是他把琴师带到了这个充满危险的时代；是他没有把琴师带在身边，避免她再次受到伤害；是他没能治好琴师的病，才导致了琴师的死亡。星云对琴师有着深深的内疚，他觉得自己是罪人，罪不可恕。